В Токіо можна недорого зупинитися в хостелах і готелях з 1-2 зірками. Наприклад, в Tokyo Hostel (3-12-5 Ryusen), Oak Hotel (6-1-2 Higashi Ueno), Palace Japan (2-31-6 Kiyokawa Taito), готелях мережі Khaosan Tokyo: Ninja (2-5-1 Bakurocho Nihombashi), Annex і Smile (2-2-5 Higashi-Komagata), Origimal (2-1-5 Kaminarimon), Samurai (1-18-3 Higashi-Komagata), Kabuki (1-17-2 Asakusa).

Тим, хто шукає японської екзотики можна порадити дорожчі, зате вкрай колоритні гостьові будинки реканах (ріокани). Це Kimi Ryokan (2-36-8 Ikebukuro), Ichifuji Ryokan (2-35-8 Asakusa), Sakura Ryokan (2-6-2 Iriya), Asakusa Toukaisou Ryokan (2-16-12 Nishiasakusa) і т. Д.

Для невибагливих туристів, лише ночують в номері, цікавим досвідом може стати проживання в капсульних готелях. У їхніх кімнатах-осередках можна тільки лежати або сидіти. Особисті речі постояльці залишають в місцевій камері схову, санвузол загальний, жінкам і чоловікам виділені різні поверхи. До таких готелів ставляться Capsule Asakusa Riverside (2-20-4-B Kaminarimon), Capsule Inn Kinshicho (2-6-3 Kinshicho), Shinjuku Kuyakusho-mae Capsule (1-2-5 Kabukicho), Capsule Inn Komagome (2 4-8 Nakazato) і ін.