На Байкалі розташовано більше 25 островів (о. Ольхон, Ушканій архіпелаг, о. Ярки, бакланів острів і ін.). Найбільшим вважається острів Ольхон, розташований майже в центрі озера у його західного узбережжя. Острів Ольхон можна відвідати самостійно на поромній переправі від Хужир, тоді як більшість інших островів вважається заповідною зоною, і доступ на них обмежений.

За островам Малого моря організовуються круїзи.