В Байкалі налічується близько 50 видів риб, з них до числа промислових відноситься лише 15. Це сиг, білий харіус, чорний харіус, ленок, таймень, осетер, минь, окунь, щука, сорога (плотва), ялець, в'язь, даватчан і карась. Головна промислова риба Байкалу - омуль.

Найцікавіша в Байкалі риба голомянка прозорого кольору і без луски, тіло якої на 35% складається з жиру. Голомянка відноситься до класу живонароджених риб і мешкає тільки на Байкалі. А ще Байкал унікальний серед інших озер тим, що на великій глибині тут ростуть прісноводні губки.