Потяги в Мальборк відправляються щоденно з Центрального залізничного вокзалу Варшави (станція Warszawa Centralna), який знаходиться за адресою Al. Jerozolimskie 54, і прибувають на станцію Malbork Kaldowo. Потяги ходять досить часто, раз на годину точно. Маршрути різні, час у дорозі залежить від кількості зупинок - в середньому близько 4 годин. Ознайомитися з розкладом руху поїздів можна на сайті польських залізниць. До Центрального вокзалу їдуть трамваї № 7, 8, 9, 10, 16, 17, 19, 22, 24, 25, 33, 43.